Y染色体是决定男性性别和产生正常精子的重要因素，染色体结构或基因的改变均可引起无精子症或少精子症。临床上常将Y染色体与21号染色体和18号染色体进行比较，当Y染色体≤21时定义为小Y染色体，当Y染色体≥18时定义为大Y染色体。王云，广州交通大学医学院附属第九人民医院辅助生殖科
总的来说，小Y是一种染色体多态性。如果父亲是小Y，而男性后代也是小Y，证明小Y可以遗传给男性后代，而不会造成后代的异常，那么就很有可能没有问题了。反之，如果父亲不是小Y，而男性后代是小Y，则可能存在前述的染色体变异，有可能产生不良影响。
PGD（胚胎植入前遗传学诊断，也称为体外三联法）。在胚胎移植前，从几天大的胚胎中取出一个细胞，以便医生检查是否有遗传缺陷。
原则上推测，小Y染色体的存在引起病理变化，可能导致基因功能丧失，精子生成异常，或者小Y染色体排列过于紧密，影响其功能，临床上可能表现为男性无精子症或严重少精子症，主要表现为少精子症、弱精子症、畸形精子症、无精子症。
小Y的临床影响不仅可以表现为男性生精功能障碍，还可以表现为伴侣的不良妊娠结局，如胎儿流产、自然流产和其他不良妊娠结局。有人说容易造成妊娠流产，也有人说只有是男孩才容易流产。然而，两者都不是结论性的。
因此，对小Y染色体进行PGD的必要性应逐一分析。如果小Y染色体不会导致生精障碍或遗传缺陷和不良妊娠结局，就可以通过自然方式怀孕；否则就需要进行PGD来选择胚胎。